Bioinformaticien.ne de recherche / Research Bioinformatician

Adoc Talent Management; Montreal; On-site; CAD 60,000 - 80,000; Full time

Job summary

Un centre de recherche de premier plan à Montréal recherche un Bioinformaticien passionné pour coordonner des projets ambitieux en génomique translationnelle. Ce rôle clé implique la mise en place de pipelines d'analyse de données de séquençage, garantissant la qualité des données et l'organisation des informations. En collaborant avec des hôpitaux pédiatriques, vous contribuerez à transformer les soins offerts aux enfants grâce à des outils de diagnostic et des traitements innovants. Si vous êtes motivé par la recherche et souhaitez faire une différence dans le domaine de la santé, cette opportunité est faite pour vous.

Qualifications

• Diplôme en bioinformatique requis, avec expérience en Bash et Python.
• Capacité à travailler de manière autonome et en équipe sur plusieurs projets.

Responsibilities

• Mise en place de pipelines pour analyser des variants génétiques.
• Organisation de réunions et rédaction d'articles pour les projets.

Skills

Programmation en Bash

Programmation en Python

Analyse bioinformatique

Gestion de données

Proactivité

Travail en équipe

Education

Diplôme universitaire en bioinformatique

Tools

NextFlow

YAML

WDL

Bases de données SQL

Job description

ENGLISH VERSION BELOW

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Passionné.e de recherche, vous souhaitez mettre à profit vos compétences scientifiques et évoluer dans un centre de recherche de premier plan et coordonner des projets ambitieux à l’échelle nationale ?

Notre client, un centre hospitalo-universitaire à Montréal, cherche un·e Bioinformaticien.ne de recherche qui sera sous la direction du responsable de la recherche, pour soutenir le développement du volet de génomique translationnelle d'un partenariat qui vise à transformer les soins pédiatriques via le développement de nouveaux paradigmes en santé de précision.

Les plus importants hôpitaux pédiatriques du pays unissent leurs forces dans un partenariat de recherche unique qui va transformer les soins offerts aux enfants. La vision est audacieuse et d'une ampleur sans précédent. Dans cette nouvelle ère des technologies de la santé, l'objectif est de partager expertises et ressources pour développer des outils de diagnostic et des traitements accessibles à tous.

Vos missions :

• Mise en place de pipelines permettant d’identifier, annoter et analyser des variants génétiques et épigénétiques à partir de données de séquençage (génome complet et transcriptome)
• Réalisation de différentes analyses bioinformatiques à partir des jeux de données générés par les séquenceurs de nouvelle génération;
• Organisation de réunions de l’équipe de projet, participation aux décisions opérationnelles et aide à la rédaction des articles et publication des projets;
• Garantie de la bonne marche de l’étude, du suivi du protocole et de la qualité des données ;
• Développement et rédaction des procédures de traitement des données dans le laboratoire, ainsi que la mise en place du système d’analyse;
• Organisation, hiérarchisation et archivage des données sur les serveurs;
• Documentation et communication sur le processus d’analyse, résultats, outils et techniques utilisés;
• Interaction avec les membres du laboratoire afin d’élaborer des stratégies d’analyses.

Votre profil :

• Diplôme universitaire en bioinformatique ou dans un domaine pertinent
• Expérience en programmation avec les langages Bash et Python dans un environnement Linux;
• Connaissance et/ou expérience avec NextFlow, YAML ou WDL
• Expérience en processus d’analyse sur des grappes de calculs HPC ou infonuagiques.
• Expérience avec des banques de données SQL
• Proactivité et capacité à travailler de façon indépendante avec supervision minimale;
• Capacité de travailler en groupe sur plusieurs projets;
• Excellente gestion des priorités, rapidité d’exécution, sens de l’organisation et gestion du temps;
• Bonne compétence en gestion de données.
• Bonne compréhension du Français, Billingue idéallement

IMPORTANT :

Les candidat.e.s étranger.e.s devront avoir un permis de travail valide qui autorise à ‘’exercer un emploi relié aux soins des enfants, à l’enseignement au primaire ou au secondaire, au domaine de la santé’’.

Vous vous reconnaissez dans cette description ? Nous vous invitons à appliquer et au plaisir de vous rencontrer.

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Passionate about research, you would like to put your scientific skills to good use and work in a leading research center, coordinating ambitious projects on a national scale?

Our client, a university hospital center in Montreal, is looking for a Research Bioinformatician who will report to the Head of Research, to support the development of the translational genomics component of a partnership that aims to transform pediatric care through the development of new paradigms in precision healthcare.

The country's leading pediatric hospitals join forces in a unique research partnership that will transform the way children are cared for. The vision is bold and unprecedented in scope. In this new era of healthcare technology, the aim is to share expertise and resources to develop diagnostic tools and treatments accessible to all.

Your Missions :

• Set up pipelines to identify, annotate and analyze genetic and epigenetic variants from sequencing data (whole genome and transcriptome).
• Carrying out various bioinformatics analyses based on data sets generated by new-generation sequencers;
• Organization of project team meetings, participation in operational decisions and assistance in writing articles and publishing projects;
• Ensuring the smooth running of the study, protocol compliance and data quality;
• Development and drafting of data processing procedures in the laboratory, as well as implementation of the analysis system;
• Organization, prioritization and archiving of data on servers;
• Documentation and communication of the analysis process, results, tools and techniques used;
• Interact with laboratory members to develop analysis strategies.

Your Profile :

• University degree in bioinformatics or relevant field
• Experience in programming with Bash and Python languages in a Linux environment;
• Knowledge and/or experience with NextFlow, YAML or WDL
• Experience in analysis processes on HPC or cloud computing clusters.
• Experience with SQL databases
• Proactivity and ability to work independently with minimal supervision;
• Ability to work in a group on several projects;
• Excellent management of priorities, speed of execution, organizational skills and time management;
• Good data management skills.
• Good understanding of French, ideally bilingual

IMPORTANT:

Foreign candidates must have a valid work permit authorizing them to ''work in a job related to child care, primary or secondary education, or the health field''.

Do you recognize yourself in this description? We invite you to apply and look forward to meeting you.