Projektassistent inom digital patologi och AI

Umeå Universitet; Umeå kommun; On-site; SEK 290,000 - 424,000; Full time

Job summary

Umeå universitet söker en projektassistent inom digital patologi och AI för annotering och bedömning av helglasbilder samt utveckling av AI-modeller. Du arbetar enligt fastställda protokoll och samarbetar med forskare, patolog och AI-utvecklare i ett dynamiskt forskningsmiljö.

Detta är en tidsbegränsad anställning på heltid med start enligt överenskommelse, ca 6 månader. Befogenheten inkluderar kvalitetsgranskning av skanningar och dokumentation som underlag för träning och validering av

Qualifications

• Minst kandidatexamen inom medicin, biomedicin eller närliggande område.
• Relevant arbetslivserfarenhet.
• Vana att arbeta med digitalt bildmaterial.
• Noggrann och strukturerad med hög kvalitetsfokus.
• Goda kunskaper i svenska och engelska i tal och skrift.
• Meriterande: erfarenhet av digital patologi och annoteringsverktyg (QuPath, TissUUmaps).
• Stor vikt vid personlig lämplighet.

Responsibilities

• Annotera och bedöma digitala helglasbilder från prostatabiopsier och operationspreparat.
• Markera tumörområden, Gleasonmönster och morfologiska drag i QuPath och TissUUmaps.
• Bedöma immunhistokemiska färgningar (Ki67, PSA och AR) enligt protokoll.
• Arbeta självständigt enligt protokoll i nära samarbete med PI, patolog och AI-utvecklare.
• Administrativa arbetsuppgifter kan ingå.

Skills

Histopatologisk bedömning

Digitalt bildmaterial

QuPath

TissUUmaps

Svenska & engelska

Education

Kandidatexamen inom medicin/biomedicin

Tools

QuPath

TissUUmaps

Job description

Projektassistent inom digital patologi och AI

Umeå universitet är ett av Sveriges största lärosäten med över 41 500 studenter och cirka 4 600 anställda. Vid universitetet finns en mångfald av utbildningar av hög kvalitet och världsledande forskning inom flera vetenskapsområden, och här gjordes den banbrytande upptäckten av gensaxen CRISPR-Cas9 som tilldelats Nobelpriset i kemi. Vid Umeå universitet är allt nära. Våra sammanhållna campus gör det lätt att mötas, samarbeta och utbyta kunskap, något som gynnar en dynamisk och öppen kultur.

Den samhällsomvandling och de stora gröna investeringar vi ser i norra Sverige skapar enorma möjligheter och komplexa utmaningar. För Umeå universitet handlar det om att bedriva forskning om – och mitt i – ett samhälle i omvandling. Men också om att leverera utbildningar för regioner som behöver expandera fort och hållbart. Det är helt enkelt här framtiden skapas.

SPRINTR är en nationell forskningsinfrastruktur för prostatacancer som leds från Umeå universitet och Region Västerbotten. Män som utreds för prostatacancer vid kliniker över hela Sverige samtycker till att deras biopsier, bilder och data används i forskning. Alla glas från högriskfall skannas, och vi utvecklar AI-verktyg som ur vanliga H&E-färgade snitt ska kunna förutsäga tumörens biologi och vilken behandling patienten har nytta av. Läs mer på www.sprintr.se.

Anställningen är tidsbegränsad 6 månader på heltid med start 261204 eller enligt överenskommelse.

Som projektassistent kommer du att annotera och bedöma digitala helglasbilder från prostatabiopsier och operationspreparat. Arbetet innebär att markera tumörområden, Gleasonmönster och andra morfologiska drag i annoteringsprogram som QuPath och TissUUmaps samt att bedöma immunhistokemiska färgningar för Ki67, PSA och AR enligt fastställda protokoll.

I arbetsuppgifterna ingår även att kvalitetsgranska snitt och skanningar samt dokumentera bedömningarna som underlag för träning och validering av AI-modeller. Bedömningarna görs enbart i forskningssyfte och återförs inte till vården. Du arbetar självständigt utifrån fastställda protokoll och i nära samarbete med projektets huvudansvariga forskare (PI), patolog och AI-utvecklare i Umeå och Uppsala. Även administrativa arbetsuppgifter kan ingå.

Kvalifikationer

Vi söker dig som har minst kandidatexamen inom medicin, biomedicin eller närliggande område samt relevant arbetslivserfarenhet.

Du har erfarenhet av histopatologisk bedömning av vävnadssnitt och vana att arbeta med digitalt bildmaterial i datorprogram. Du är noggrann och strukturerad samt har förmåga att bibehålla hög kvalitet vid systematisk bedömning av stora mängder bildmaterial.

Du har god förmåga att uttrycka dig på svenska och engelska i tal och skrift, eftersom båda språken används i arbetsgruppen.

Det är meriterande om du har:

• erfarenhet av digital patologi och annoteringsverktyg, exempelvis QuPath och TissUUmaps,
• pågående forskarutbildning inom patologi, cancerforskning eller bildanalys.

Stor vikt kommer att läggas vid personlig lämplighet.

Umeå universitet vill erbjuda en jämställd och jämlik miljö där öppna samtal mellan människor med olika bakgrund och perspektiv lägger grunden för lärande, skaparkraft och utveckling. Vi välkomnar därför personer med olika bakgrunder och erfarenheter att söka den aktuella anställningen.

Anställningsform Särskild visstidsanställning

Anställningens omfattning

Tillträde

Löneform Månadslön

Antal lediga befattningar

Sysselsättningsgrad

Ort Umeå

Referensnummer