Postdoktor inom populationsgenomik – anpassning hos lantsorter av råg

SLU Future Food; Katrineholms kommun; On-site; SEK 420,000 - 520,000; Full time

Benefits offered by this job

Föräldrapenningtillägg

Hälso- och sjukvårdsförmåner

Friskvårdsbidrag

Job summary

Institutionen för skoglig mykologi och växtpatologi vid SLU söker en postdoktor som kommer att använda populationsgenomik för att undersöka hur råg anpassar sig till olika miljöer och vilken roll mikrobiotan spelar. Du leder det genomiska arbetet i projektet Eko-evolution av råg och dess mikrobiella allierade.

Anställningen är tvåårig och platsen är Uppsalas forskningsmiljö. I arbetet ingår fältstudier och växthusstudier samt samarbete med internationella forskare vid Uppsala Universitet och

Qualifications

• Erfarenhet av att analysera data från högkapacitetssekvensering för populationsgenomik.
• Erfarenhet av att arbeta via command line i ett beräkningskluster samt av skriptprogrammering (bash, R eller Python).
• Goda kunskaper i engelska i tal och skrift för vetenskapligt skrivande och rapportering.

Responsibilities

• Samla in frö från rågpopulationer i norra Europa, odla dem under växthusförhållanden och karaktärisera deras fysiologiska egenskaper och tillhörande mikrobsamhällen.
• Analysera data från helgenomsekvensering för att beskriva genetisk mångfald och populationsstruktur.
• Koppla genomisk variation till växtegenskaper, mikrobsamhällen och miljö genom genom–miljö-analys.
• Arbeta i forskargruppen för markmikrobiologi vid SLU och samarbeta med evolutionsbiologer vid andra universitet.

Skills

Högkapacitetssekvensering

Command line/scripting

Engelska (vetenskapligt skrivande)

Education

Doktorsexamen i biologi

Job description

Institutionen för skoglig mykologi och växtpatologi

Bli en del av Institutionen för skoglig mykologi och växtpatologi vid Sveriges lantbruksuniversitet (SLU) i en tvåårig postdoktorsanställning där du använder populationsgenomik för att ta reda på hur råg anpassar sig till olika miljöer och vilken roll dess mikrobiota spelar. Du kommer att leda det genomiska arbetet i projektet ’Eko-evolution av råg och dess mikrobiella allierade’, finansierat av Vetenskapsrådet, och även utföra en del fältarbete och växthusstudier.

Om jobbet

Råg (Secale cereale L.) odlas där andra sädesslag har svårt att klara sig eftersom råg bättre tål kyla, torka och näringsfattiga jordar. Till skillnad från sina nära släktingar vete och korn är råg korsbefruktande, vilket gör att den kan behålla en hög genetisk mångfald. Det gör råg till ett kraftfullt modellsystem för att förstå om mikroorganismer bidrar till hur växter anpassar sig till sin miljö, och hur domesticeringen har stört detta samspel. Lantsorter av råg är dessutom på väg tillbaka på gårdarna, vilket gör att vi kan studera levande populationer på de platser som har format dem, i stället för att enbart förlita oss på genbanksmaterial.

Du Kommer Att Studera Rågpopulationer Som Sträcker Sig Från Vilda Och Ogräsartade Släktingar Till Lantsorter Och Inavlade Högavkastande Sorter. Dina Huvudsakliga Arbetsuppgifter Blir Att

• samla in frö från rågpopulationer i norra Europa, odla dem under standardiserade förhållanden i växthus samt karakterisera deras fysiologiska och fenologiska egenskaper och tillhörande mikrobsamhällen
• analysera data från helgenomsekvensering för att beskriva den genetiska mångfalden och populationsstrukturen hos rågpopulationerna
• koppla genomisk variation till växtegenskaper, mikrobsamhällen och miljö för att identifiera drivkrafter bakom anpassning, till exempel genom genom–miljö-associationsanalyser
• Du kommer att arbeta i forskargruppen för markmikrobiologi vid Institutionen för skoglig mykologi och växtpatologi, som fokuserar på att förstå vilken roll mikroorganismer spelar i biogeokemiska processer. Du kommer också att ingå i ett bredare nätverk av samarbetspartner som stöttar det genomiska arbetet, bland annat evolutionsbiologer vid Uppsala universitet och specialister på grödgenomik vid University of Melbourne i Australien.

Din bakgrund

Vi söker dig som har doktorsexamen i biologi med inriktning mot populationsgenetik, evolutionsbiologi, bioinformatik, ekologi, lantbruksvetenskap eller ett närliggande område, och som har dokumenterad förmåga att bedriva självständigt vetenskapligt forskningsarbete och att skriva vetenskapliga publikationer. Vi ser också gärna att du är mycket motiverad, öppen för nya perspektiv och trivs med att arbeta i team, och att du vill bidra positivt till forskningsmiljöns utveckling.

Krav

• erfarenhet av att analysera data från högkapacitetssekvensering för populationsgenomik, från rå sekvenseringsdata till analyser på populationsnivå
• erfarenhet av att arbeta via the command line i ett beräkningskluster samt av skriptprogrammering, till exempel i bash, R eller Python
• goda kunskaper i engelska i tal och skrift, för vetenskapligt skrivande, rapportering och deltagande i internationella projektaktiviteter
• Det är meriterande om du har:
  • erfarenhet av data från helgenomsekvensering, särskilt från stora genom
  • erfarenhet av att koppla genomisk variation till egenskaper eller miljö
  • kunskap om evolutionära och ekoevolutionära processer hos växter
  • erfarenhet av att arbeta med växter eller data om mikrobsamhällen
  • körkort

Vi förväntar oss inte att du har alla dessa meriter. Om din erfarenhet av genomik kommer från ett annat studiesystem är du mycket välkommen att söka, och vi stöttar dig i att lära dig arbetet med växter och mikroorganismer.

Anställningen som postdoktor är avsedd för en forskare tidigt i karriären. Vi söker därför främst personer som har avlagt doktorsexamen högst tre år före sista ansökningsdag. Om din examen är äldre på grund av föräldraledighet, sjukdom, fackliga uppdrag, militärtjänstgöring eller liknande omständigheter, ange detta i din ansökan. Om du är nära att slutföra din forskarutbildning är du välkommen att söka, förutsatt att doktorsexamen är avlagd innan beslut om anställning fattas.

Vid bedömningen läggs även vikt vid personliga egenskaper, såsom förmåga att samarbeta, arbeta självständigt och kommunicera tydligt.

Om oss

Institutionen för skoglig mykologi och växtpatologi vid SLU har en framstående internationell position inom forskning. Vi bedriver både grundläggande och tillämpad forskning med fokus på de viktiga interaktionerna mellan växter, svampar och andra mikroorganismer i skogs- och jordbrukssystem. Våra huvudsakliga forskningsområden är skoglig och agrar växtpatologi, interaktioner mellan växter, mark och mikroorganismer, mikrobiell och molekylär ekologi, jämförande genomik samt biologisk bekämpning. Vi arbetar med angelägna frågor som förlust av biologisk mångfald, försämrade ekosystemfunktioner och effekterna av inhemska och invasiva skadegörare och sjukdomar. Vårt arbete syftar till att utveckla hållbara metoder inom jord- och skogsbruk, särskilt i ett förändrat klimat, för att minimera miljöpåverkan och ekonomiska förluster.

Mer information om institutionen/avdelningen: www.slu.se/mykopat

Mer information om projektet: https://www.slu.se/en/research/research-catalogue/projekt/e/eco-evolution-of-rye-and-its-microbial-allies/

Bland förmånerna finns föräldrapenningtillägg, hälso- och sjukvårdsförmåner och friskvårdsbidrag. Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba vid SLU på https://www.slu.se/om-slu/jobba-pa-slu/

Placering

Uppsala

Anställningsform

Tidsbegränsad anställning 24 månader, med möjlighet till förlängning. Om du är föräldraledig under anställningen erbjuds du en förlängning som motsvarar minst föräldraledighetens längd.

Omfattning

100%

Tillträde

Våren 2027 eller enligt överenskommelse.

Fackliga Kontaktpersoner

https://internt.slu.se/min-anstallning/facket/kontaktpersoner/

• Monique Smith
• biträdande universitetslektor,
• [e-mail]

Sveriges lantbruksuniversitet (SLU) har en nyckelroll i utvecklingen för hållbart liv, grundad i vetenskap och utbildning. Genom vårt fokus på samspelen mellan människa, djur och ekosystem och ett ansvarsfullt brukande av naturresurserna bidrar vi till en hållbar samhällsutveckling och goda livsvillkor på vår planet. Huvudorter är Alnarp, Umeå och Uppsala, men verksamhet bedrivs också på forskningsstationer, försöksparker och utbildningsorter i hela landet. SLU har drygt 4000 medarbetare, 6000 studenter och forskarstuderande och en omsättning på över 4,5 miljarder kronor. Universitetet satsar på attraktiva miljöer på sina campusområden. Vi arbetar för en jämställd och inkluderande arbetsmiljö där öppna samtal mellan människor med olika erfarenheter lägger grunden för vetenskaplighet, kreativitet och utveckling. Vi välkomnar därför personer med olika bakgrunder och perspektiv att söka den aktuella anställningen.

Fler lediga jobb Sök denna tjänst