Forskarsassistent i cancerbioinformatik – AI & patologi

Karolinska Institutet; Solna kommun; On-site; SEK 312,000 - 402,000; Full time

Benefits offered by this job

Flexibelt arbetssätt

Friskvårdsanläggning

Job summary

Karolinska Institutet i Solna söker en forskningsassistent inom cancerbioinformatik som kommer att arbeta i en tvärvetenskaplig och internationell miljö vid BioClinicum. Projekten fokuserar på AI, digital patologi och cancergenomik med analyser av storskaliga histopatologiska och genomiska data.

Du bidrar till utveckling av beräkningsflöden i Python och R, samt utför statistiska analyser av kliniska utfall.

Qualifications

• Krav på examen inom ett närliggande område (bioinformatik, datavetenskap, biostatistik, datalogi, biomedicinsk teknik eller beräkningsbiologi).
• Stark intresse för AI och beräkningspatologi inom cancerforskning.
• Gedigen erfarenhet av Python och utveckling/utveckling av analysflöden för biomedicinsk data.
• Praktisk erfarenhet av djupinlärningsmodeller för prediktion av genuttryck från histopatologi.
• Vana vid förbehandling av WSI och integration av bild- och genomikdata samt klinisk metadata.

Responsibilities

• Analysera digitala patologibilder och genomiska data i projektet.
• Utveckla och utvärdera djupinlärningsmodeller för cancerbiologi.
• Integrera bild- och genomikdata med klinisk metadata och analysera resultat.
• Arbeta i Python/R samt utnyttja HPC-resurser för beräkningar.

Skills

Python

Djupinlärning

WSI-förbehandling

Engelska (kommunikation)

Beräkningsmetoder

Education

Examen inom bioinformatik/datalogi/biostatistik/beräkningsbiologi

Tools

SEQUOIA

HE2RNA

Path2Space

Job description

Karolinska Institutet i Solna söker en forskningsassistent inom cancerbioinformatik som kommer att arbeta i en tvärvetenskaplig och internationell miljö vid BioClinicum. Projekten fokuserar på AI, digital patologi och cancergenomik med analyser av storskaliga histopatologiska och genomiska data.

Du bidrar till utveckling av beräkningsflöden i Python och R, samt utför statistiska analyser av kliniska utfall.