HPC Engineer – Build & Optimize Compute Cluster

Erasmus MC; Rotterdam; On-site; EUR 42,000 - 65,000; Full time

Benefits offered by this job

Pensioenverzekering ABP

Reiskostenvergoeding

Sportfaciliteiten Erasmus MC

Fietsenmaker service

Job summary

Erasmus MC zoekt een medior IT engineer voor een nieuw multidisciplinair team dat een HPC-omgeving beheert ter ondersteuning van onderzoekers en bioinformatici. Je werkt samen met senior IT-collega's aan ontwikkeling, testen en optimalisatie van de compute-infrastructuur en cloud-schaalbaarheid.

Je groeit stap voor stap in je rol onder begeleiding van ervaren collega's en levert bijdragen aan installatie, training en documentatie voor optimaal gebruik door wetenschappers.

Qualifications

• Minimaal 3 jaar ervaring in het onderhouden van compute infrastructuur.
• HBO werk- en denkniveau met voorkeur HBO-opleiding Computerwetenschappen of vergelijkbaar.
• Affiniteit met bioinformatica en wetenschappelijk onderzoek.
• Kennis van IT-infrastructuur incl opslag, servers, netwerk design, hardware (GPU/CPU) en virtuele machines.
• Ervaring met Linux en cluster provisioning zoals Ansible playbooks.
• Ervaring met wetenschappelijke software-omgevingen zoals containers (Apptainer/Singularity), modulesystemen (EasyBuild, Spack, Lmod) en Conda.
• Bekendheid met workflow managers als Nextflow of Snakemake.
• Begrip van high-performance compute en clusteringtechnieken zoals SLURM.
• Bekendheid met ITIL-processen zoals incidentmanagement, change management en SLA's.
• Ervaring met agile werken of bereidheid om deze vaardigheden te ontwikkelen.
• Doorzettingsvermogen en uitstekende Nederlandse en Engelse schriftelijke en mondelinge communicatievaardigheden.

Responsibilities

• Meewerken aan de ontwikkeling en optimalisatie van het High Performance compute cluster.
• Monitoring, logging en documentatie om kwaliteit, performance en betrouwbaarheid te waarborgen.
• Samenwerken met de senior IT-engineer, onderzoekers en de Product Owner om nieuwe functies te realiseren.
• Optimalisatie van het rekencluster, workloads en opslag voor snelheid, efficiëntie en kostenbeheersing.
• Onderhouden van cluster (SLURM), servers, opslag en virtuele machines.
• Beantwoorden van vragen van gebruikers en oplossen van problemen.
• Opzetten en geven van cursussen over HPC-gebruik aan wetenschappers op basis van best practices.

Skills

Compute infrastructuur

Linux

Ansible

Apptainer/Singularity

EasyBuild

Spack

Lmod

Conda

Nextflow

Snakemake

SLURM

ITIL

Agile

Nederlandse en Engelse communicatie

Education

HBO werk- en denkniveau

HBO-opleiding In Computerwetenschappen of vergelijkbaar

Tools

Ansible

Apptainer/Singularity

EasyBuild

Spack

Lmod

Conda

Nextflow

Snakemake

SLURM

Job description

Erasmus MC zoekt een medior IT engineer voor een nieuw multidisciplinair team dat een HPC-omgeving beheert ter ondersteuning van onderzoekers en bioinformatici. Je werkt samen met senior IT-collega's aan ontwikkeling, testen en optimalisatie van de compute-infrastructuur en cloud-schaalbaarheid.

Je groeit stap voor stap in je rol onder begeleiding van ervaren collega's en levert bijdragen aan installatie, training en documentatie voor optimaal gebruik door wetenschappers.