Bio-informaticus/Data Engineering

Werkenbijdeoverheid; Den Haag; On-site; EUR 55,000 - 85,000; Full time

Benefits offered by this job

Individueel keuzebudget (IKB)

Studiefaciliteiten

Bedrijfsfitness

Ov-reiskostenvergoeding woon-werkverke

Ouderschapsverlof

Job summary

Werkenbijdeoverheid zoekt een Bioinformaticus/Data Engineer voor het team Niet-humane Biologische Sporen (NHBS). Je ontwikkelt en optimaliseert pipelines om genetische data af te leiden en te interpreteren uit microbiomen, diatomeeën, schimmels, planten en dieren.

Je bouwt en beheert de NHBS-data-infrastructuur en zorgt voor een efficiënte dataflow tussen lab en data scientists. Je werkt samen in een Data Science-gilde met andere Python Developers en Data Scientists, levert bijdragen aan

Qualifications

• Minimaal een HBO/HLO bachelor diploma in bioinformatica of data-engineering.
• Goede beheersing van de Nederlandse taal in woord en schrift.
• Ervaring met data vanuit nieuwe sequencing technieken zoals Illumina/NanoPore.
• Actuele kennis van Python en versiebeheer (zoals Git).
• Ervaring met opzetten en beheren van databases.
• Ervaring met automatische beeldherkenning is een pré.
• Accuraat werken, samenwerken, plannen en organiseren en zelfontwikkeling.

Responsibilities

• Ontwikkelen en optimaliseren van bioinformatica pipelines voor analyse en interpretatie van genetische data (microbiomen, diatomeeën, schimmels, planten en dieren).
• Ontwerpen, bouwen en onderhouden van de data-infrastructuur van NHBS.
• Verzamelen, opslaan en verwerken van data met kennis van de dataflow en technische issues.
• Samenwerken met Python Developers en Data Scientists in een data science gilde.

Skills

Python

Data analyse

Database management

Communicatie

Teamwork

Education

HBO/HLO bachelor in bioinformatica of data-engineering

Tools

Git

SQL

Databases

Job description

Hoe kan de informatie uit forensisch onderzoek aan planten, dieren en micro-organismen door het Nederlands Forensisch Instituut effectief worden gebruikt binnen strafrechtelijk onderzoek? Dat is dé vraag waar je als onderzoeker binnen het onderzoeksteam “Niet-humane Biologische Sporen (NHBS)” mee aan de slag gaat. Ben jij in staat om tools te ontwikkelen om een breed scala aan data te ontsluiten en te analyseren, zodat collega’s deze informatie kunnen toepassen in forensisch (zaak)onderzoek? Ben je daarnaast creatief en nauwkeurig om binnen ons team databases te vullen en te ontsluiten voor het bepalen van de bewijskracht? Dan zijn we op zoek naar jou!

Als Bio-informaticus/Data Engineer binnen het team Niet-humane biologische sporen (NHBS) werk je mee aan onderzoek aan sporen die afkomstig zijn van andere levensvormen dan de mens. Dit kunnen zowel zichtbare sporen van planten en dieren als met het blote oog onzichtbare sporen zijn, zoals diatomeeën en bacteriën. Dit onderzoek wordt uitgevoerd in het kader van strafrechtelijk onderzoek in levensdelicten, zedenmisdrijven, drugszaken, maar bijvoorbeeld ook bij overtreding van de flora- en faunawetgeving.

Niet-humane biologische sporen kunnen worden gebruikt om een verband aan te tonen tussen voorwerpen in het bezit van een verdachte en de plaats delict. Ook kunnen deze sporen helpen bij het verifiëren van scenario’s en bepalen van tijdslijnen. De sporen kunnen echter ook zelf het hoofdonderwerp in een strafzaak zijn, bijvoorbeeld bij het onderzoek aan biologische drugs, vergiftigingen en de illegale handel in beschermde planten- en diersoorten.

Je schrikt niet terug voor uitgebreid experimenteren. Het werk bestaat uit ontwikkelen en optimaliseren van nieuwe bioinformatica pipelines voor het analyseren en interpreteren van genetische gegevens van microbiomen, diatomeeën, schimmels, planten, dieren (eDNA). Hierbij is data van DNA-technologie zoals “massive parallel sequencen” maar ook vanuit geautomatiseerde analyse van microscopische preparaten jouw belangrijkste onderzoeksmateriaal. Daarnaast ben je verantwoordelijk voor het ontwerpen, bouwen, onderhouden en uitbreiden van de data-infrastructuur van NHBS. Dit is nodig voor het vergaren, opslaan en verwerken van data. Hiervoor is kennis nodig over hoe de data vergaard is, welke (technische) issues er aan dergelijk verkregen data kan kleven, en wat er met de data bereikt moet worden (data analyse) en wat niet. Door deze kennis is optimale verbinding tussen lab en data scientists geborgd.

Binnen het NFI zijn meerdere datalabs verenigd in een data science gilde, waarbinnen kennis uitgewisseld wordt. Daarnaast is er ruimte om samen met andere Python Developers en Data Scientists aan aanvullende uitdagende forensische data science-vraagstukken te werken.

• Arbeidsovereenkomst voor bepaalde tijd
• 12 maanden
• Op deze functie is het Functiegebouw Rijk van toepassing. Inschaling vindt plaats op basis van je opleiding en ervaring. Voor kandidaten die de functie in eerste instantie nog niet volledig en zelfstandig beheersen kan een aanloopschaal worden toegepast. Een aanloopschaal is één schaal lager dan de betreffende functieschaal en in dit geval betreft het dus aanloopschaal 9 CAO Rijk.

Dit bieden we nog meer

Naast het salaris ontvang je een individueel keuzebudget (IKB). Het IKB bestaat uit geld (16,5 % van je brutojaarsalaris) en tijd. Met het IKB maak jij de keuzes die bij jou passen en kun je een deel van je arbeidsvoorwaarden zelf samenstellen. Je kunt er bijvoorbeeld voor kiezen om een deel van je maandinkomen te laten uitbetalen wanneer jij dat wenst. Ook kun je dit budget omzetten in verlof en andersom of besteden aan fiscaalvriendelijke doelen. De Rijksoverheid hecht sterk aan persoonlijke groei en loopbaanontwikkeling en biedt daarvoor tal van mogelijkheden. Tot de secundaire arbeidsvoorwaarden behoren onder meer verschillende studiefaciliteiten, bedrijfsfitness, volledige vergoeding van je ov-reiskosten woon-werkverkeer en gedeeltelijk betaald ouderschapsverlof.

Dit vragen wij

• Je hebt minimaal een HBO/HLO bachelor diploma in de richting van de bioinformatica of data-engineering.
• Je hebt een goede beheersing van de Nederlandse taal in woord en geschrift.
• Je hebt ervaring met data vanuit nieuwe sequencing technieken zoals Illumina/NanoPore.
• Je hebt actuele en aantoonbare kennis van Python en versiebeheer (zoals Git).
• Je hebt ervaring met het opzetten en beheren van databases.
• Ervaring met automatische beeldherkenning is een pré.
• Accuraat werken
• Samenwerken
• Plannen en organiseren
• Zelfontwikkeling

Wat vinden wij nog meer belangrijk

Als bio-informaticus/data engineer ben je proactief en communicatief vaardig. Je voelt je verantwoordelijk voor het teamresultaat, pakt graag teamtaken op en komt zelf met een verrassend nieuw onderzoeksvoorstel. Het afstemmen over projecten met collega’s en het geven van een presentatie doe jij met plezier. Je blijft jezelf graag ontwikkelen, of het nu is op gebied van Python, bio-informatica of beeldherkenning en draagt je opgedane kennis graag over op je collega's. Binnen onze projecten werken we in teamverband, daarom zoeken we een betrokken collega die open staat voor feedback en feedback geeft op een constructieve manier.

Meer over Divisie Chemische en Fysische Sporen

Je werkt in een team dat onderdeel is van de divisie Chemische & Fysische Sporen. Deze divisie is verantwoordelijk voor snelle betrouwbare chemische identificatie van bekende en onbekende stoffen en anticipeert op nieuwe stoffen en materialen. CFS beantwoordt vragen omtrent aard, samenstelling en herkomst van bijzondere stoffen en materialen. Het vergelijkend onderzoek van chemische en fysische sporen verbindt materialen, plaats delict (PD), verdachte en slachtoffer. Innovatie richt zich met name op het verkrijgen van meer informatie uit minder sporen, de verbinding tussen stoffen/materialen en personen, tijdstippen en locaties en de relatie van de sporen met de activiteiten die hebben geleid tot het spoor. Hiermee wordt invulling gegeven aan de NFI-missie: Gericht op waarheid, geleid door wetenschap, voor een veiliger samenleving.

Het team Niet-Humane Biologische Sporen (NHBS) bestaat uit verschillende onderzoekers die een breed vakgebied bestrijken. Bij het uitvoeren van zaakonderzoek wordt veelvuldig samengewerkt met andere onderdelen van het NFI zoals Verdovende Middelen, Humane Biologische Sporen en Toxicologie. Vanwege de diversiteit van aangeleverde sporen en toe te passen technieken en het te leveren maatwerk in zaakonderzoek, werkt het team in een soort matrix structuur. Daarom is samenwerking en een goede sfeer extra belangrijk.

Werken bij de Rijksoverheid betekent een bijdrage leveren aan een beter Nederland. Dus ook aan een veilige en rechtvaardige samenleving voor iedereen. Justitie en Veiligheid verdedigt en beschermt de rechtsorde. Van beleid tot uitvoering. Het Nederlands Forensisch Instituut (NFI) is een agentschap van het ministerie van Justitie en Veiligheid en levert kwalitatief hoogwaardige forensische diensten met behulp van state-of-the-art technologie en wetenschap. Gedreven NFI-professionals richten zich gezamenlijk op het tijdig leveren van begrijpelijke, objectieve en zo nodig multidisciplinaire forensische analyses, op meer dan dertig onderzoeksgebieden zoals DNA, pathologie en toxicologie, maar bijvoorbeeld ook digitale technologie en wapens. De resultaten spelen een belangrijke rol bij opsporing, vervolging en in rechtszaken. In alle gevallen houdt het NFI zich bezig met zaken die direct van invloed zijn op het dagelijks leven. Dat maakt werken voor het NFI zo bijzonder. Want recht raakt mensen.

Over de functiegroep Onderzoeksmedewerker

Door het Functiegebouw Rijk worden medewerkers en leidinggevenden geholpen bij het maken van resultaat- en ontwikkelafspraken in functioneringsgesprekken en krijgt men inzicht in de loopbaanmogelijkheden binnen de Rijksoverheid.