Développement d’anticorps monoclonaux pour le diagnostic et le traitement des infections à Kleb[...]

CEA Paris-Saclay Laboratoire des Pathogènes Gram-négatifs multirésistants; Fontenay-aux-Roses; Sur place; EUR 40 000 - 60 000; Plein temps

Résumé du poste

Un laboratoire de recherche en biologie recherche un candidat pour un projet de doctorat axé sur les souches de Klebsiella pneumoniae. Le projet implique des analyses génomiques, la production d'anticorps monoclonaux et le développement d'outils de détection. Le candidat idéal a de l'expérience en biologie et possède des compétences en apprentissage machine. Le début souhaité est le 1er octobre.

Qualifications

• Expérience ou connaissance des méthodes d'analyse génomique.
• Compétences en production et caractérisation d'anticorps monoclonaux.
• Compréhension des outils d'apprentissage machine.

Responsabilités

• Décrire la circulation des clones de hvKp par analyse génomique.
• Produire et caractériser des Ac monoclonaux.
• Développer un outil de détection rapide.

Formation

Thèse de doctorat en biologie

Description du poste

Topic description

Nous observons depuis quelques années l’émergence de souches de Klebsiella pneumoniae hyper-virulentes (hvKp) devenues très résistantes aux antibioques. Dans un contexte de raréfaction des options antibiotiques, les anticorps (Ac) monoclonaux dirigés contre des antigènes capsulaires bien conservés de ses souches d’HvKp apparaissent comme une alternative thérapeutique prometteuse.

For several years, we have observed the emergence of hypervirulent (hvKp) strains of Klebsiella pneumoniae that have become highly resistant to antibiotics. In a context of dwindling antibiotic options, monoclonal antibodies (Abs) directed against well-conserved capsular antigens of these hvKp strains appear as a promising therapeutic alternative.

This PhD project is structured around three complementary objectives :

1. Décrire la circulation des clones de hvKp par analyse génomique comparative des souches collectées via le Centre National de Référence de la Résistance aux Antibiotiques et via une collaboration internationale.
   To describe the circulation of hvKp clones through comparative genomic analysis of strains collected via the French National Reference Center for Antibiotic Resistance and through an international collaboration.
2. Produire et caractériser des Ac monoclonaux dirigés contre la capsule de HvKp.
   Produce and characterize monoclonal Abs directed against the HvKp capsule.
3. Développer un outil de détection rapide basé sur l’analyse des profils MALDI-TOF couplée à des algorithmes de machine learning.
   Develop a rapid detection tool based on MALDI-TOF profile analysis coupled with machine learning algorithms.

Pôle fr : Direction de la Recherche Fondamentale

Département : Institut de biologie François JACOB

Service : Immunologie des maladies virales et auto-immunes-Infectious Disease Models and Innovative Therapies

Laboratoire : Laboratoire des Pathogènes Gram-négatifs multirésistants

Date de début souhaitée : 01-10-

Ecole doctorale : Innovation Thérapeutique : du Fondamental à l’Appliqué (ITFA)

Directeur de thèse : DORTET Laurent

Organisme : AP-HP

URL : Funding category

Public / private mixed funding

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