Investigador/a Postdoctoral Bioinformático especialista en Genómica

Agencia De Vivienda Y Rehabilitacion De Andalucia; Sevilla; Presencial; EUR 30.000 - 40.000; Jornada completa

Descripción de la vacante

Una fundación pública en Andalucía busca un/a Investigador/a Postdoctoral Bioinformático especializado en Genómica. El candidato ideal tiene un doctorado en Tecnologías de la Información y Comunicaciones y experiencia en análisis de datos de múltiples secuencias. Las funciones incluyen la implementación de pipelines de procesamiento de datos y desarrollo de modelos para enfermedades. Se requiere un nivel de inglés B2 y experiencia en investigación internacional.

Formación

• Experiencia de al menos dos años en análisis de datos genómicos.
• Experiencia en modelado de métodos de aprendizaje supervisado.
• Conocimiento en lenguajes de flujos de trabajo como CWL o WDL.

Responsabilidades

• Implementación de pipelines de procesamiento de datos genómicos.
• Desarrollo de modelos para búsqueda de dianas terapéuticas.
• Implementación de algoritmos de aprendizaje supervisado.

Conocimientos

Análisis de datos genómicos

Programación en Python

Trabajo con herramientas de secuenciación

Modelado de aprendizaje supervisado

Uso de técnicas computacionales de imputación

Educación

Doctorado en Tecnologías de la Información y Comunicaciones

Herramientas

BWA

GATK

FastP

samtools

picard

Descripción del empleo

Oferta de empleo

Investigador/a Postdoctoral Bioinformático especialista en Genómica

Información general

Fundación Pública Andaluza Progreso y Salud, M.P.

Requisitos

• Doctorado en Tecnologías de la Información y Comunicaciones.
• Experiencia de al menos dos años en análisis primario completo de datos genómicos tanto para DNA-Seq (WGS/WES) como RNA-Seq.
• Experiencia de al menos dos años en manejo de herramientas comunes en análisis de datos de secuenciación (BWA, Novoalign, FastP, samtools, picard, GATK o similares).
• Experiencia de al menos dos años en modelado y optimización de métodos de aprendizaje supervisado y aprendizaje profundo aplicados a genómica y farmacogenómica, así como técnicas computacionales de imputación.
• Estar en posesión de la documentación reglada para su contratación laboral en España.
• Conocimientos de lenguajes de programación (Python, Perl, Matlab, R, C).
• Conocimiento de lenguajes de flujo de trabajo para el desarrollo de pipelines como CWL o WDL.
• Nivel de inglés: B2 MCER o similar.
• Experiencia postdoctoral en el extranjero.
• Experiencia en proyectos genómicos.

Funciones

• Implementación y puesta a punto de pipelines de procesamiento de datos genómicos procedentes tanto de DNA-Seq como RNA-Seq.
• Desarrollo de modelos computacionales para la búsqueda de dianas terapéuticas para enfermedades raras y cáncer a partir de perfiles genómicos.
• Implementación de algoritmos de aprendizaje supervisado para el desarrollo de herramientas de reposicionamiento y priorización de fármacos.
• Recuperación y regeneración de datos genómicos mediante inferencia e imputación a partir de paneles de referencia.