Bioinformático

Ombú Consulting; Pamplona; Híbrido; EUR 60.000 - 90.000; Jornada completa

Descripción de la vacante

Ombú Consulting busca un/a Computational Biologist / Bioinformatics & AI/ML Scientist con sólida formación cuantitativa y biológica para trabajar en una startup biotecnológica en crecimiento. Diseñarás y validarás workflows y modelos para drug discovery usando datos multimodales de alta dimensionalidad, con un enfoque práctico en HPC y/o cloud.

Se requiere PhD (o MSc con experiencia equivalente) y experiencia en DNA-seq, RNA-seq y proteómica, con dominio de Python y PyTorch.

Formación

• PhD en Bioinformática, Ciencias Computacionales, Biología Computacional, Ingeniería Biomédica, Bioestadística o afines (o MSc con experiencia equivalente, 2 años)
• Experiencia en DNA-seq, bulk y single-cell RNA-seq, proteómica e integración multi-ómica
• Dominio de Python (pandas, numpy, scikit-learn, PyTorch)
• Conocimientos sólidos de álgebra lineal, cálculo y estadística
• Experiencia con Git, contenedorización y pipelines en HPC/cloud
• Disponibilidad para trabajar remoto desde España; presencial 2 días/semana en Pamplona

Responsabilidades

• Diseñar, desarrollar, implementar y validar workflows y modelos para drug discovery.
• Curar, integrar, normalizar y mantener bases de datos públicas y propietarias.
• Desarrollar y aplicar modelos de ML y DL a problemas biológicos.
• Evaluar y optimizar modelos mediante benchmarking y validación de generalización.
• Desarrollar pipelines reproducibles y escalables para HPC y/o cloud.
• Colaborar estrechamente con equipos experimentales para traducir resultados computacionales en planes de laboratorio.

Conocimientos

Python

ML/DL

Analytical thinking

Ownership

Educación

PhD en Bioinformática o afín

Herramientas

pandas

numpy

scikit-learn

PyTorch

Descripción del empleo

Buscamos un/a Computational Biologist / Bioinformatics & AI/ML Scientist con sólida formación cuantitativa y biológica para incorporarse a una startup biotecnológica en crecimiento y trabajar estrechamente con equipos científicos.

La persona seleccionada será responsable de diseñar, desarrollar, implementar y validar workflows y modelos computacionales para resolver problemas de drug discovery, aprovechando datos biológicos multimodales de alta dimensionalidad.

Responsabilidades principales

• Curar, integrar, normalizar y mantener bases de datos públicas y propietarias.
• Diseñar e implementar workflows reproducibles para el análisis de datos genómicos, transcriptómicos, proteómicos y clínicos.
• Desarrollar y aplicar modelos de machine learning y deep learning a problemas de biología y drug discovery.
• Evaluar y optimizar modelos mediante estrategias adecuadas de benchmarking, validación y análisis de generalización.
• Desarrollar pipelines reproducibles y escalables para ejecución en HPC y/o cloud.
• Seleccionar metodologías apropiadas y comunicar supuestos y limitaciones.
• Colaborar estrechamente con equipos experimentales para traducir resultados computacionales en planes de laboratorio y viceversa.
• Diseñar y ejecutar experimentos computacionales para testar hipótesis biológicas y evaluar de forma rigurosa la robustez de los resultados.
  
• PhD en Bioinformatica, Computer Science, Computational Biology, Biomedical Engineering, Biostatistics o afines, o MSc con experiencia equivalente en entorno industrial relevante (al menos 2 años de experiencia).
• Se requiere experiencia práctica en las siguientes áreas: DNA-seq, bulk y single-cell RNA-seq, proteomica, integración multi-ómica, ML/DL aplicados a datos biológicos, diseño de algoritmos y modelos computacionales para problemas biológicos complejos.
• Dominio de Python, incluyendo experiencia con librerías como pandas, numpy, scikit-learn y PyTorch.
• Conocimientos sólidos de álgebra lineal, cálculo y estadística.
• Experiencia con Git, contenerización y ejecución de pipelines en entornos HPC y/o cloud.
• Sólida comprensión de biología molecular y celular con capacidad para comprender mecanismos biológicos a nivel celular y tisular. Se valorará experiencia en inmunología.
• Pensamiento analítico y científico, con capacidad para descomponer problemas complejos y formular hipótesis testables. Rigor en el análisis y en la interpretación de resultados.
• Capacidad para trabajar con autonomía y ownership de proyectos. Orientación a resultados y capacidad para trabajar en un entorno dinámico y orientado a la innovación.
• Disponibilidad para trabajar remoto desde España. Priorizamos candidatos que puedan estar presencial 2 días por semana en Pamplona.
  

Participar en proyectos científicos aplicados, con impactodirecto en el desarrollo de terapias biológicas, combinando modeladocomputacional y validación experimental. Con alta autonomía técnica, trabajocercano con investigadores y exposición al ciclo completo de I+D en un entornocolaborativo y de aprendizaje continuo.