Adjoint-e scientifique 3

University of Geneva; Genf; Vor Ort; CHF 120.000 - 180.000; Vollzeit

Zusammenfassung

L’Universite9 de Gene8ve, Faculte9 de me9decine, Plateforme de science des donne9es biome9dicales (BDSF) recherche un adjoint-e scientifique pour renforcer l53e9quipe bioinformatique et soutenir les chercheurs avec des analyses statistiques et bioinformatiques avance9es.

Vous contribuerez e0 de9velopper des pipelines reproductibles, e9 rester e0 la se9curite9 des donne9es sensibles et c rb9 accompagner la formation des e9quipes, en veillant e0 la trae7abilite9 et e0

Qualifikationen

• Docteur ou équivalent dans un domaine pertinent.
• Au moins 10 ans d’expérience en analyses de données biomédicales et bioinformatique.
• Au moins 5 ans d’expérience en administration des systèmes informatiques liés à la bioinformatique.
• Solides connaissances en bioinformatique et statistique et technologies générant les données omiques.
• Gestion et stockage de données sensibles et cliniques.
• Maîtrise du codage R et/ou Python, Linux et HPC, et reproductibilité des analyses (docker, singularity, markdown, github).

Aufgaben

• Contribuer à l’analyse et l’interprétation des données biomédicales.
• Conseiller les chercheurs sur les technologies et approches d’analyse.
• Développer et maintenir des pipelines reproductibles.
• Former les membres de la plateforme et assurer la traçabilité des données.
• Veiller aux bonnes pratiques de programmation et sécurité des données.

Kenntnisse

R et Python

Linux HPC

Bioinformatique

Statistiques

Docker

Singularity

Markdown

GitHub

Ausbildung

PhD en mathématique, physique, biologie, bioinformatique, ingénierie, informatique

Tools

Docker

Singularity

Markdown

GitHub

Jobbeschreibung

Description du poste

La Faculté de médecine de l'Université de Genève bénéficie d'une dynamique multiculturelle enrichissante à laquelle elle contribue par son rayonnement dans le cadre des mandats qu'elle s'est donnés : l'enseignement, la recherche et son partenariat avec les Hôpitaux Universitaires de Genève (HUG).

La Plateforme de science des données biomédicales (BDSF) de la Faculté de médecine supporte les laboratoires dans leur projets de recherche. Elle apporte l'expertise bioinformatique et statistique nécessaire à l'analyse de tous types de données et la visualisation des résultats pour leur publication.

La plateforme a pour but de conseiller, de former et d'aider les scientifiques à exploiter efficacement les données de laboratoire, quel que soit le domaine de recherche.

Adjoint-e scientifique 3 à 90%

La mission principale de ce poste est de renforcer l’équipe bioinformatique du BDSF pour soutenir les chercheurs de la Faculté de médecine, en leur fournissant des conseils et des analyses statistique et bioinformatique de pointe.

Tâches Principales

• Assurer l’application de bonnes pratiques de programmation, stockage et reproductibilité et former les membres de la plateforme


• Assurer la sécurité du stockage et des analyses de données sensibles et former les membres de la plateforme


• Contribuer à la gestion, la structuration et la traçabilité des données et former les membres de la plateforme


• Assurer une veille méthodologique et technologique


• Développer, maintenir et documenter des pipelines d’analyse reprotuctibles


• Réaliser des analyses statistiques et bioinformatiques de données biomédicales et aider les chercheurs pour interpréter les résultats


• Conseiller les chercheurs sur le choix des technologies et approches d’analyse de données

Titre et compétences exigés

• PhD en mathématique, physique, biologie, bioinformatique, ingénierie, informatique ou autre domaine similaire


• Au moins 10 ans d’expérience dans le domaine des analyses de données biomédicales et de la bioinformatique.


• Au moins 5 ans d’expérience en administration des systèmes informatiques liés à la bioinformatique.


• Solides connaissances en bioinformatique et statistique, ainsi qu’en technologies générant les données (omiques, single cell, FACS, spectrométrie)


• Solides connaissances dans la gestion (traitement et stockage) de données sensibles, données cliniques


• Maîtrise du codage informatique en R et/ou python, environnement Linux et HPC, ainsi que les techniques de reproductibilité et traçabilité des analyses (docker, singularity, markdown, github)

Entrée en fonction

01.01.2027

Contact

Des renseignements complémentaires peuvent être obtenus auprès de Nadine Fournier, coordinatrice du BDSF.

Informations complémentaires

Contrat de droit privé à durée déterminée de 12 mois, renouvelable.

L'Université de Genève offre des conditions d’engagement motivantes dans un cadre de travail stimulant. En nous rejoignant, vous aurez l'occasion de mettre en valeur vos compétences ainsi que votre personnalité et contribuer activement au rayonnement d'une Institution fondée en 1559.

Dans une perspective de parité, l'Université encourage les candidatures du sexe sous-représenté.